使用有机肥生产线处理动物粪便是理想的方法，畜牧业污染主要指畜牧业生产粪尿污染，畜牧产品中有毒有害物质的残留及来自畜禽场的废物。其中主要的是畜禽粪尿污染和畜禽产品残留构成的对人类健康的困扰。养殖业产生的污染已成为中国农村地区污染的主要来源。
  动物产出粪便的现实问题据统计，如果不引起重视，处理不好，将会对环境产生严重的污染及影响。比如，由于动物粪便得不到及时处理，会对地表水、地下水、土壤和空气造成严重污染。粪便的无害化处理粪便的无害化处理，就是利用有机肥生产线科学的杀灭或去除粪便中的致病微生物和寄生虫卵，同时能保存粪便的肥效，处理的粪便能达到无害化卫生标准的要求。目前，我国农村普遍采用的粪便无害化处理方法有高温堆肥和建立沼气池，作为沼气生产原料。但更多的还是收集堆沤后作农家肥返田。 高温堆肥是利用堆肥自身产生的温度50—70度来达到杀菌灭卵的目的。
  我国南方一些发达县市，在大力发展畜牧生产的同时，有机肥生产线的大功能就是体现在养殖行业当中，着力抓好养殖污染治理问题，大限度降低畜禽粪便对环境的污染。使用了有机肥生产线之后境况就完全不同，利用有机肥生产线可轻松处理动物粪便，使养殖行业不再忧虑。