有机肥生产设备自20世纪以来，畜牧业由分散饲养改为规模化、集约化饲养，所产生的粪便数量也迅速增加，加上排放、堆积集中，严重影响周围的环境和水资源，迫切需要畜禽粪便的工业此处理及合理利用。目前一些较大规模的畜禽养殖场产生的粪便已经直接处理后堆放，常采用的有厌气发酵产生沼气、设计人工湿地系统、热风直接烘干等方式。
  经过处理后的牲畜粪便含水量在20％左右，基本去除了臭味，消除了虫卵及病原茵，养分也得以保留，加上在除臭过程中加入的一些沸石粉等臭味吸附剂，理化性状得到改善。
  畜禽粪便富含有机质，含有较高的微量元素，是很好的制作有机肥料的原料。但是不同的动物粪便其养分含量和特性有差异，在配方使用时应予以考虑。如鸡粪中的养分多为速效态，使用较多易烷苗，而牛粪中养分的释放较缓和，使用起来比较安全。
  此外，由于饲料据加剂的普迫使用，近年来百合粪便中的微量元素含量增高，有机肥生产设备在含有微量元素的配方中应将这一部分考虑进去，以免连续大量使用该肥料造成微量元素的累积过量。